@aperalesf igual ya sabes esto (e igual te lo he comentado yo). Hay varias maneras de acceder a carpetas compartidas Samba. Sospecho que estás usando la funcionalidad propia de Gnome.

Es muy práctica, pero sólo los programas integrados con Gnome funcionan bien de esta manera, y es posible que alguno de los problemas que tienes estén relacionados con esto.

Quizá te conviene investigar otras maneras de acceder a carpetas Samba (busca "fstab samba").

@aperalesf si "montas" las carpetas Samba con "fstab" o similares, entonces en teoría los programas no tienen que lidiar con el soporte de Gnome de Samba y hay menos margen para problemas.

(Seguramente todo esto no es excesivamente usable y requiere demasiados conocimientos arcanos, lamentablemente. Creo que macOS hace el equivalente de "fstab samba". En Windows hay problemas similares [aunque más pequeños] a los de Gnome, curiosamente...)