@microblogc yo no tengo mucha idea, pero le eché un ojo ayer y el gestor de discos de Windows tiene una opción para encoger particiones. La documentación de Microsoft podría decir indirectamente que puede apretujar los archivos (porque dice que hay archivos que *no* puede apretujar- ergo será que hay archivos que sí puede).
¿Ya lo has probado?
No me sorprendería que defrag no sea apropiado...